- 第1章 我是谁？我是小智！
- 第2章 命中注定的相遇
- 第3章 闪光独角虫和与女孩的初次相遇
- 第4章 初见
- 第5章 火箭队三人组
- 第6章 蚊香蝌蚪和尼多朗
- 第7章 常磐森林里的相遇
- 第8章 终到尼比市和宝可梦的进化
- 第9章 道馆挑战以及小刚的入队
- 第10章 研究员
- 第11章 月见山
- 第12章 进化与雕画
- 第13章 华蓝道馆
- 第14章 代理道馆主之战
- 第15章 智霞之战（上）
- 第16章 智霞之战（下）
- 第17章 非正式道馆（上）
- 第18章 非正式道馆（下）
- 第19章 宝可梦班
- 第20章 优藤圣代（上）
- 第21章 优藤圣代（下）
- 第22章 碧蓝
- 第23章 与碧蓝的对决（上）
- 第24章 与碧蓝的对决（下）
- 第25章 妙蛙种子
- 第26章 妙蛙种子Get？Daze
- 第27章 规划与特训
- 第28章 风雨中被抛弃的小火龙
- 第29章 苏醒的小火龙
- 第30章 约战大佑
- 第31章 战大佑
- 第32章 胜利与小火龙入队
- 第33章 杰尼龟军团（上）
- 第34章 杰尼龟军团（中）
- 第35章 杰尼龟军团（下）
- 第36章 休整
- 第37章 正辉的灯塔（上）
- 第38章 正辉的灯塔（下）
- 第39章 巨大快龙（上）
- 第40章 巨大快龙（下）
- 第41章 快龙岛
- 第42章 闲逛快龙岛
- 第43章 快龙的馈赠
- 第44章 骑在快龙的背上
- 第45章 再会
- 第46章 检查（过渡，可跳）
- 第47章 尼多王（上）
- 第48章 尼多王（中）
- 第49章 尼多王（下）
- 第50章 花子的到来