陈玉成命令前沿部队稍作抵抗后，便佯装不支，有序向后撤退，诱使清军深入。同时，将主力精锐和火力最强的部队，预先埋伏在清军进攻路线两侧的有利地形之后，并集中了军中所有的掷弹筒和部分迫击炮，瞄准了预设的歼敌区域，只等吉尔杭阿上钩。
吉尔杭阿眼见太平军“望风而逃”，不由抚掌大笑：
“贼寇果然不堪一击！”
他扬鞭直指溃退的太平军，喝令全军追击。旌旗猎猎，清军如潮水般涌向山谷，阵型早已散乱不堪，侧翼更是门户大开。余万清在后方看得真切，急忙策马追上：
“大人，敌军退而不乱，山谷地势险要，恐有埋伏啊！”
吉尔杭阿勃然变色，马鞭直指余万清面门：
“懦夫安敢乱我军心！再敢多言，军法处置！”
当清军主力尽数涌入葫芦口峡谷时，站在山顶了望台的陈玉成猛地握紧剑柄。朝阳正刺破晨雾，将他的身影镀上一层金边。
“发信号！开火！”
令旗随之挥动。霎时间，寂静的山谷化作炼狱——两侧山腰的灌木丛中突然竖起数百杆火枪，密集的弹雨如同飞蝗般倾泻而下。正在谷底挤作一团的清军还来不及反应，就已成片倒下，鲜血瞬间染红了青石板路。
“轰！轰轰！”
太平军精心布置的掷弹筒阵地发出震天怒吼。炮弹精准落在清军队列最密集处，爆炸产生的气浪将官兵掀上半空，残肢断臂四处飞溅。一队试图组织反击的骑兵刚举起马刀，就被迫击炮准确覆盖，人仰马翻间，战马的悲鸣与伤兵的哀嚎响彻山谷。
吉尔杭阿的帅旗在硝烟中剧烈摇晃。这位江苏巡抚脸色惨白，徒劳地挥舞佩刀：
“列阵！快列阵！”
可他的命令在震耳欲聋的爆炸声中显得如此微弱。亲兵队长刚想护住主帅，突然眉心绽开血花，直挺挺地从马背栽落。
“活捉吉尔杭阿！”
太平军战士如猛虎下山般从四面八方涌来。一枚迫击炮弹在帅旗附近炸开，吉尔杭阿的坐骑悲鸣着跪倒，将他狠狠甩落在地。等他挣扎着爬起，赫然发现太平军的红头巾已形成合围。寒光闪闪的长矛抵住他的咽喉，那面绣着“吉尔”二字的将旗被狠狠踩进泥泞。
山谷东侧，余万清目睹主帅被擒，当即劈断帅旗：
“亲卫队随我来！”
他带着百余骑拼死突围，太平军故意网开一面，任其溃逃。待逃回镇江城头，清点残部竟不足三百人，余万清望着城外升起的太平军战旗，颓然跪地：
“江南大势去矣……”
二十里外，正率军前来会师的张国梁接到探马急报，惊得手中马鞭坠地。他望着远处升起的滚滚浓烟，突然调转马头：
“快！撤回大营！”
“撤回大营！”
这支乌合之众般的部队顿时作鸟兽散准备打道回府，辎重粮草丢弃一路，狼狈不堪的又缩回大营去了。
这一幕惹得监视他们的黑鸦队员一阵好笑，
“这些都是些什么玩意？”
此役，太平军以精妙战术和优势火力，几乎全歼了吉尔杭阿带来的生力军，自身伤亡微乎其微。吉尔杭阿的被俘，更是对清廷士气的沉重打击，也彻底暴露了江南大营外强中干的本质，以及满清贵族将领的无能。