杨素把情况一条条写下来回复杨广，结果宫人误把回信送到了杨坚的寝宫，导致杨坚看后极为愤怒，天刚亮，宣华夫人出去更衣，被杨广所逼迫。
宣华夫人拒绝了他才得以脱身，她回到文帝的寝宫，杨坚奇怪她神色不对，问什么原因，宣华夫人流着泪说太子无礼。
杨坚愤怒，捶着床说这个畜生，怎么可以将国家大事交付给他，独孤氏误了我，于是他叫来柳述、元岩说召见我的儿子。
柳述等人要叫杨广来。杨坚却说要召见的是杨勇，柳述、元岩出了杨坚的寝宫，起草敕书，杨素闻知此事，告诉了杨广。
杨广假传杨坚的旨意将柳述、元岩逮捕，关进大理狱，他们迅速调来东宫的裨将兵士来宿卫仁寿宫，宫门禁止出入，并派宇文述、郭衍进入调度指挥。
命令右庶子张衡进入仁寿宫侍侯杨坚。后宫的人员全被赶到别的房间去，随后，杨坚在大宝殿驾崩，庙号高祖，谥号文皇帝，葬于泰陵。
杨坚在政治方面做出的贡献不少，他废除不合时宜的北周六官天、地、春、秋、冬、夏制，恢复了汉魏时期的体制，基本上确立了三省六部制度。
杨坚在中央设立三师、三公、五省，三师、三公只是一种荣誉虚衔。掌握政权的是五省，即内侍省、秘书省、门下省、内史省和尚书省。
内侍省、秘书省在国家政务中不起重要作用，内侍省是宫廷的宦官机构，管理宫中事务。
秘书省掌管书籍历法，事务较少，起作用的是其他三省，内史省、门下省、尚书省都是最高政务机构。
内史省负责决策，门下省负责审议，尚书省负责执行，这就是后来被唐朝继承的三省制。
尚书省下设吏、民、礼、兵、刑、工六部。每部设尚书，总管本部政务，具体办事机构就是这是六部。
吏部，掌管全国官吏的任免、考核、升降和调动；民部，掌管全国的土地、户籍以及赋税、财政收支；礼部，掌管祭祀、礼仪和对外交往。
兵部，掌管全国武官的选拔，和兵籍、军械等；刑部，掌管全国的刑律、断狱；工部，掌管各种工程、工匠、水利、交通等。
开始的时候，六部叫做六曹，即六个办事机构。六部的长官为尚书，六部的设置成为后代封建国家中央政权的固定制度。
三省六部制分工明确，组织严密，大大加强了中央集权。
开皇十年杨坚诏府兵入州县户籍，兵农合一始此，杨坚对于地方机构也进行了改革。
他采纳度支尚书杨尚希提出的存要去闲、并大去小的建议，将原来比较混乱的地方官制从州、郡、县精简为州、县两级，撤消境内五百多郡。
同时裁汰了大量的冗官，将一些郡县合并，大大节省了政府的开支，提高了行政效率，也减轻了人民的负担。
为了更好地行使权力，控制地方，杨坚下令，九品以上的官员一律由中央任免，官吏的任用权一概由吏部掌握，禁止地方官就地录用僚佐。
而且每年都要由吏部进行考核，以决定奖惩、升降。后来，又实行三年任期制。杨坚简化了地方行政机构，废九品宫人法，初创科举制。
隋文帝命令各州每年推选三个文章华美、有才能的人，到中央受官，后来，隋文帝又下令，京官五品以上，地方官部管刺史，要由有德有才的举人担当。
这种选拔政府官员的制度，使各个阶层有才华的人都有机会为政府效力，杨坚开创建立的科举制度，在中国历史上留存长达一千三百多年，直到清朝末期才废除。
北周的法律既残酷又混乱。隋朝建立后，开皇元年杨坚下令命高熲等人参考魏晋旧律，制订《开皇律》。
开皇三年杨坚又命苏威、牛弘修改新律，删除苛酷条文，《开皇律》将原来的宫刑、车裂、枭首等残酷刑法予以废除。
规定一概不用灭族刑，减去死罪八十一条，流罪一百五十四条，徒、杖等罪千余条，保留了律令五百条，刑罚分为死、流、徒、杖、笞五种。
基本上完成了自汉文帝刑制改革以来的刑罚制度改革历程，这就是封建五刑制。
死刑复奏制度是从开皇十五年形成定制的，杨坚规定凡判处死刑的案件，须经三奏才能处决死刑。
《开皇律》对后世律法影响深远，杨坚修订的法律唐朝都基本上继承了。
在澄清吏治方面，杨坚得国以来，励精图治，兼且天资刻薄，自不容贪污枉法之行为存在。
杨坚命柳盛持节巡省河北五十二州，奏免长吏赃污不称者二百余人，州县肃然。吏治之整肃，不仅上裕国库，下纾民困，隋高祖在位时之隆盛，此亦为要因。
隋于汉长安城东南筑新城，名大兴城，在今西安城及城东、城南、城西一带。即唐长安城。
隋朝开国之初，都城仍在长安旧城，因久经战乱，残破不堪，而且宫室形制狭小，不能适应新建的统一国家都城的需要。
加之几百年来城市污水沉淀，壅底难泄，饮水供应也成问题，因此，杨坚放弃龙首原以北的故长安城，于龙首原以南汉长安城东南选择新址。
开皇二年正月，杨坚命宇文恺负责设计建造新城--大兴城，翌年三月竣工。
宇文恺参照北魏洛阳城和东魏、北齐邺都南城，把龙首原以南的六条高坡视为乾之六爻，并以此为核心，作为长安城总体规划的地理基础。
六坡“是大兴城的骨架，皇宫、政权机关和寺庙都高高在上，与一般居民区形成鲜明对照，冈原之间的低地，除居民区外，则开渠引水，挖掘湖泊，增大了城市的水域。
在此之前，从秦汉一直到南北朝，都城之中的城市格局，没有章法，没有布局，皇宫、官署、民居，交错相处，十分杂乱。
至大兴城之后，都城的均衡对称格局开始形成，街道整齐划一，南北交错，东西对称，大街小巷，井井有条。皇宫、皇城、民居三个部分相对分开，界线分明，既安全，又实用。